СР-1 был создан ЦНИИТОЧМАШ в начале 90-х годов в рамках армейского конкурса на создание нового пистолета и 9-мм патрона повышенной эффективности. Хотя разработка в итоге не вызвала интереса у армии, на СР-1 обратили внимание спецслужбы: с патроном 9х21мм СП-10 пистолет способен эффективно поражать цели в бронежилетах на расстоянии до 50 метров.
В процессе использования в СР-1 было решено внести ряд конструкторских изменений. Правкам подверглись защёлка магазина, рамка, прицельные приспособления и кнопка автоматического предохранителя на рукоятке. После внесённых изменений пистолет получил название СР1М.
В «Калибре» 9-мм пистолет СР1М в качестве дополнительного оружия используют оперативники спецподразделения «ФСБ 2004».